More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3554 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  73.76 
 
 		 463 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 493 aa  993    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3742  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.94 
 
 		 474 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.15 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0014  glutathione reductase oxidoreductase protein  51.83 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  40.35 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  37.39 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  42.09 
 
 		 451 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  38.22 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 451 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  38.11 
 
 		 451 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  41.87 
 
 		 451 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  41.87 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  39.11 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  38.68 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  41.87 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  41.87 
 
 		 451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  42.09 
 
 		 451 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  39.64 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  36.14 
 
 		 451 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  40.53 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  40.18 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  40.49 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.17 
 
 		 457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  39.87 
 
 		 459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.22 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.74 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  40.79 
 
 		 464 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  38.14 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  37.09 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  36.87 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.6 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  39.87 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 453 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  41.07 
 
 		 451 aa  280  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  38.16 
 
 		 474 aa  280  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  41.2 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  38.98 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  35.62 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  39.64 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  39.64 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  35.62 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0003  NADPH-glutathione reductase  38.86 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.02 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  40.84 
 
 		 455 aa  276  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  41.43 
 
 		 452 aa  276  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  39.6 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06221  glutathione reductase (NADPH)  38.86 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  39.25 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  40.8 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  39.16 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  39.6 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  37.34 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  39.51 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  36.58 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  39.91 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0447  glutathione reductase  38.19 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.026364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  38.36 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  39.91 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.91 
 
 		 452 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  38.36 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  41.02 
 
 		 453 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  36.3 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  35.09 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  35.63 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  38.33 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  35.9 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.49 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.49 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  37.61 
 
 		 459 aa  266  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  35.09 
 
 		 452 aa  266  8e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  35.84 
 
 		 451 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0976  NADPH-glutathione reductase  41.01 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.911583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  35.62 
 
 		 451 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  37.2 
 
 		 461 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  35.56 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  35.4 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  37.89 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  35.4 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  38.46 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  36.38 
 
 		 462 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  35.18 
 
 		 452 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  37.39 
 
 		 461 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  37.39 
 
 		 461 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  35.18 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  38.5 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.04 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  35.31 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  37.39 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  38.94 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  36.46 
 
 		 454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0889  glutathione reductase (NADPH)  40.44 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  34.96 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  34.29 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>