More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0666 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
452 aa  916    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.9 
 
 
456 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.66 
 
 
448 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.86 
 
 
448 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  45.82 
 
 
452 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.78 
 
 
448 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.31 
 
 
450 aa  343  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  41.03 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.11 
 
 
449 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  40.4 
 
 
450 aa  326  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.68 
 
 
449 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  36.79 
 
 
455 aa  296  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  38.15 
 
 
443 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  34.44 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  34.23 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  34.61 
 
 
461 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  32.41 
 
 
446 aa  220  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  33.93 
 
 
461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  34.16 
 
 
449 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  33.86 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  33.71 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  32.96 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  32 
 
 
451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  33.33 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  32.96 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  32.96 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  33.18 
 
 
452 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  31.31 
 
 
451 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.68 
 
 
461 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  33.11 
 
 
451 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  32.88 
 
 
451 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  33.26 
 
 
451 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  33.63 
 
 
474 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  32.88 
 
 
452 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  35.16 
 
 
451 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  32.43 
 
 
470 aa  210  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  32.89 
 
 
459 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  34.29 
 
 
453 aa  209  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  32.44 
 
 
452 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  33.48 
 
 
461 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  32.73 
 
 
451 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  33.33 
 
 
451 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.07 
 
 
452 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  32.89 
 
 
451 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  33.48 
 
 
451 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  32.66 
 
 
452 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  31.67 
 
 
460 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  31.78 
 
 
464 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  31.19 
 
 
457 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  33.19 
 
 
458 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  31.76 
 
 
466 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  31.92 
 
 
453 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  34.44 
 
 
452 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  33.64 
 
 
461 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.33 
 
 
546 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  29.93 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  32.73 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.18 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  29.05 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2195  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase, putative  27.29 
 
 
447 aa  200  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  32.81 
 
 
452 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  30.54 
 
 
452 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  29.27 
 
 
451 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  31.72 
 
 
450 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  30.16 
 
 
452 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  31.61 
 
 
459 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  29.05 
 
 
451 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  33.56 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  30.16 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  28.82 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  29.71 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  31.5 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  30.38 
 
 
451 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  30.84 
 
 
450 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  29.93 
 
 
451 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  28.6 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  32.58 
 
 
448 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  31.03 
 
 
450 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  33.33 
 
 
452 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  32.45 
 
 
459 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  32.36 
 
 
452 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  32.74 
 
 
455 aa  196  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  30.34 
 
 
462 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  30.34 
 
 
449 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  32.89 
 
 
461 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  32.52 
 
 
465 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.74 
 
 
466 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  34.58 
 
 
461 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.14 
 
 
461 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>