More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2904 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
448 aa  914    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  68.08 
 
 
448 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  45.5 
 
 
452 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.66 
 
 
452 aa  411  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.67 
 
 
456 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.22 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  40.31 
 
 
450 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.96 
 
 
448 aa  363  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  39.65 
 
 
450 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.9 
 
 
449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.42 
 
 
449 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  36.5 
 
 
455 aa  336  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  36.38 
 
 
443 aa  269  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  33.72 
 
 
435 aa  252  9.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  34.59 
 
 
451 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  33.33 
 
 
451 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  34.37 
 
 
451 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  33.56 
 
 
452 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  33.92 
 
 
451 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  34.74 
 
 
453 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  34.74 
 
 
453 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  34.74 
 
 
453 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  34.74 
 
 
453 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  34.74 
 
 
453 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  34.74 
 
 
453 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  34.74 
 
 
453 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  28.88 
 
 
459 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  30.8 
 
 
446 aa  220  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  32.82 
 
 
452 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  33.78 
 
 
451 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  33.56 
 
 
451 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  32.59 
 
 
452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  34.07 
 
 
452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  32.89 
 
 
452 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  32.89 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.07 
 
 
546 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  32.07 
 
 
466 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  33.48 
 
 
451 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  31.91 
 
 
452 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  32.96 
 
 
459 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  33.18 
 
 
453 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  33.04 
 
 
451 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  32.52 
 
 
451 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.6 
 
 
453 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  32.52 
 
 
451 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  32.67 
 
 
451 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  31.03 
 
 
451 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2195  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase, putative  27.01 
 
 
447 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  31.57 
 
 
452 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  29.58 
 
 
451 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  29.19 
 
 
454 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06231  glutathione reductase (NADPH)  28.26 
 
 
454 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  32.08 
 
 
451 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  32.29 
 
 
459 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  34.15 
 
 
767 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  29.87 
 
 
448 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05931  glutathione reductase (NADPH)  28.26 
 
 
454 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.351259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0806  glutathione reductase  30.47 
 
 
443 aa  203  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  31.26 
 
 
446 aa  203  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.63 
 
 
767 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  30.67 
 
 
446 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  29.96 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  33.11 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  32.31 
 
 
448 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  29.75 
 
 
546 aa  199  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.75 
 
 
546 aa  199  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  32.96 
 
 
449 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  30.13 
 
 
457 aa  199  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  29.89 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05711  glutathione reductase (NADPH)  30.22 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.356851  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.63 
 
 
745 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0003  NADPH-glutathione reductase  29.85 
 
 
453 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  32.59 
 
 
546 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
463 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  30.65 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06221  glutathione reductase (NADPH)  29.85 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0321346  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1191  glutathione reductase  28.57 
 
 
446 aa  196  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  31.25 
 
 
461 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  29.23 
 
 
451 aa  196  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 
470 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.22 
 
 
712 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.67 
 
 
469 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.18 
 
 
475 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  31.47 
 
 
461 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.18 
 
 
475 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  34.27 
 
 
459 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  31.58 
 
 
507 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  29.1 
 
 
451 aa  193  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  29.04 
 
 
453 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.25 
 
 
459 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  30.82 
 
 
460 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  29.2 
 
 
450 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  28.66 
 
 
458 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  27.97 
 
 
451 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  35.41 
 
 
459 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  26.71 
 
 
451 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  32.59 
 
 
475 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1461  glutathione reductase  30.94 
 
 
460 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.32 
 
 
457 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  32.36 
 
 
550 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>