More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2419 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
458 aa  892    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.95 
 
 
452 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2073  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.73 
 
 
458 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.785339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4442  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.43 
 
 
469 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.03 
 
 
462 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.09 
 
 
448 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.53 
 
 
448 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2717  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  40.73 
 
 
472 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.65 
 
 
451 aa  276  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201849  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.54 
 
 
449 aa  274  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0080326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.69 
 
 
517 aa  269  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.73 
 
 
467 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0298342  normal  0.259477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37510  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  40.54 
 
 
493 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102404  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0937  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.65 
 
 
493 aa  256  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486491  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.12 
 
 
453 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.65246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.26 
 
 
452 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.391833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10810  oxidoreductase  36.86 
 
 
499 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000610041  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  37.95 
 
 
474 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.93 
 
 
499 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5845  mercuric reductase, truncated  40.43 
 
 
470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.499074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.96 
 
 
475 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0813  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.53 
 
 
484 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.74 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.05 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0665  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.65 
 
 
488 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
585 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2170  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.04 
 
 
445 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  30.43 
 
 
460 aa  232  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.08 
 
 
456 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
459 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  34.49 
 
 
720 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.44 
 
 
472 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  32.9 
 
 
458 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1337  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  37.93 
 
 
500 aa  230  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3562  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.57 
 
 
482 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  33.69 
 
 
459 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.92 
 
 
473 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  35 
 
 
590 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  35 
 
 
459 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7133  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.95 
 
 
481 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00959772  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  34.78 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  34.29 
 
 
486 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  32.91 
 
 
457 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4083  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.98 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931282  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  32.76 
 
 
460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  33.33 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.96 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  35.89 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  32.97 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.74 
 
 
472 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  36 
 
 
470 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  31.65 
 
 
479 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.2 
 
 
473 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.68 
 
 
704 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  32.47 
 
 
516 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  34.14 
 
 
475 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  35.03 
 
 
767 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34 
 
 
471 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  32.27 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  32.97 
 
 
459 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  32.97 
 
 
459 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.32 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  31.85 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  31.85 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  32.61 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  32.9 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  32.61 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  32.61 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  36.06 
 
 
745 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.25 
 
 
738 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  32.48 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  29.85 
 
 
460 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  34 
 
 
507 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.18 
 
 
472 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.29 
 
 
722 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.77 
 
 
468 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 
465 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  31.58 
 
 
453 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  31.1 
 
 
459 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  32.61 
 
 
459 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.11 
 
 
458 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  35.06 
 
 
548 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  31.75 
 
 
458 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4489  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.24 
 
 
480 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  31.47 
 
 
551 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  33.56 
 
 
507 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  29.69 
 
 
464 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.44 
 
 
722 aa  206  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  33.55 
 
 
467 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.51 
 
 
458 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.09 
 
 
466 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  28.51 
 
 
479 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  36.68 
 
 
505 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  34.93 
 
 
479 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.82 
 
 
474 aa  206  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  33.33 
 
 
459 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.34 
 
 
488 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  29.24 
 
 
464 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.85 
 
 
713 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  32.53 
 
 
547 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>