More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4442 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4442  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
469 aa  920    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  88.91 
 
 
462 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  59.66 
 
 
452 aa  541  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2073  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.02 
 
 
458 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.785339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.31 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.67 
 
 
448 aa  299  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.66 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201849  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.97 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0080326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.32 
 
 
448 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.74 
 
 
453 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.65246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.82 
 
 
517 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904468  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0665  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.84 
 
 
488 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0813  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.38 
 
 
484 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2717  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  36.97 
 
 
472 aa  242  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.69 
 
 
452 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.391833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0937  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.76 
 
 
493 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486491  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.45 
 
 
467 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0298342  normal  0.259477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2170  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.02 
 
 
445 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37510  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  39.92 
 
 
493 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  33.82 
 
 
459 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  33.82 
 
 
459 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  33.82 
 
 
459 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10810  oxidoreductase  35.58 
 
 
499 aa  229  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000610041  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  34.85 
 
 
551 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.51 
 
 
499 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3562  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.51 
 
 
482 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.17 
 
 
474 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.41 
 
 
472 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  32.98 
 
 
550 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  32.98 
 
 
457 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  30.91 
 
 
460 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.82 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4083  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.5 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931282  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  35.22 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.53 
 
 
585 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  34.1 
 
 
475 aa  220  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  33.33 
 
 
479 aa  220  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.91 
 
 
714 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  35.82 
 
 
474 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  33.19 
 
 
459 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  30.91 
 
 
714 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  32.64 
 
 
459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.24 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.55 
 
 
458 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  32.29 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  32.29 
 
 
590 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  32.63 
 
 
507 aa  216  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  32.29 
 
 
459 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  31.42 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  35.03 
 
 
720 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  29.57 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  35.64 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.63 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  32.91 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.77 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.18 
 
 
488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  29.35 
 
 
464 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  35.46 
 
 
767 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  32.98 
 
 
503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  33.19 
 
 
459 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  33.54 
 
 
461 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  34.03 
 
 
745 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  32.77 
 
 
467 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.31 
 
 
471 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.99 
 
 
460 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  32.48 
 
 
552 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  30.02 
 
 
458 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 
459 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.26 
 
 
717 aa  210  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  35.14 
 
 
767 aa  210  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.26 
 
 
546 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.25 
 
 
473 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  33.19 
 
 
472 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5845  mercuric reductase, truncated  38.33 
 
 
470 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.499074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 
472 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.47 
 
 
456 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  33.41 
 
 
468 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1337  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  36.49 
 
 
500 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.74 
 
 
475 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
475 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  35.22 
 
 
470 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  31.56 
 
 
455 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  31.52 
 
 
459 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7133  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.19 
 
 
481 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00959772  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  32.29 
 
 
459 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  31.99 
 
 
458 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.11 
 
 
475 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  33.77 
 
 
548 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  31.45 
 
 
704 aa  206  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.77 
 
 
738 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  35.63 
 
 
557 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  32.85 
 
 
516 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  32.08 
 
 
459 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.82 
 
 
713 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  32.2 
 
 
458 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  32.08 
 
 
459 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.33 
 
 
484 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  32.61 
 
 
486 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  31.03 
 
 
459 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  31.03 
 
 
459 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>