More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1855 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  100 
 
 
452 aa  894    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.391833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.98 
 
 
448 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.88 
 
 
449 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0080326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.42 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201849  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.28 
 
 
448 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2170  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.76 
 
 
445 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.83 
 
 
467 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0298342  normal  0.259477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  39.25 
 
 
452 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.26 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.91 
 
 
453 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.65246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2073  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.01 
 
 
458 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.785339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.02 
 
 
462 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4489  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.25 
 
 
480 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.43 
 
 
499 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4442  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.21 
 
 
469 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2717  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  38.14 
 
 
472 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.4 
 
 
517 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904468  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0937  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.39 
 
 
493 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486491  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  38.85 
 
 
474 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7133  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.9 
 
 
481 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00959772  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.3 
 
 
459 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5845  mercuric reductase, truncated  39.02 
 
 
470 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.499074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10810  oxidoreductase  35.64 
 
 
499 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000610041  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37510  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  37.47 
 
 
493 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102404  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0813  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.83 
 
 
484 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0665  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.8 
 
 
488 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.24 
 
 
458 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 
484 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3562  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.39 
 
 
482 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
484 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
484 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4083  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.01 
 
 
478 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931282  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1337  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  34.87 
 
 
500 aa  217  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0113  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.01 
 
 
505 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 
463 aa  216  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.59 
 
 
459 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
470 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3978  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.17 
 
 
428 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.614782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  35.82 
 
 
562 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  31.59 
 
 
704 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  31.99 
 
 
467 aa  210  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  32.84 
 
 
503 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.6 
 
 
546 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  32.19 
 
 
479 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  34.49 
 
 
562 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.26 
 
 
454 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.43 
 
 
470 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  33.7 
 
 
457 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  35 
 
 
468 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  34.39 
 
 
484 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  34.96 
 
 
547 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  35.21 
 
 
561 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.49 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.04 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  34.75 
 
 
547 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
470 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 
466 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  33.33 
 
 
548 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  31.89 
 
 
550 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
464 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.93 
 
 
459 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  32.17 
 
 
468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  31.3 
 
 
469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.65 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  32.35 
 
 
459 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
470 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
470 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
470 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.33 
 
 
713 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
470 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  29.67 
 
 
713 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  33.12 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.41 
 
 
460 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 
451 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  33.26 
 
 
452 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  33.69 
 
 
560 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  34.19 
 
 
565 aa  196  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
454 aa  196  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.91 
 
 
470 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  33.83 
 
 
459 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.91 
 
 
470 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  33.69 
 
 
481 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  30.59 
 
 
462 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.91 
 
 
470 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.86 
 
 
459 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  33.76 
 
 
561 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
458 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.17 
 
 
472 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  28.95 
 
 
546 aa  194  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  30.82 
 
 
452 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.4 
 
 
450 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  34.41 
 
 
561 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.11 
 
 
474 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  28.95 
 
 
546 aa  194  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  33.47 
 
 
516 aa  194  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>