142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0824 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  87.3 
 
 
189 aa  334  5e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  86.77 
 
 
189 aa  330  8e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  55.1 
 
 
204 aa  221  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.57 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  29.11 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.67 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  27.84 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  30.48 
 
 
213 aa  85.1  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.38 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  29.19 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  33.19 
 
 
238 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  32.16 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  27.89 
 
 
201 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.22 
 
 
226 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  24.77 
 
 
377 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.85 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  27.5 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  27.66 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  24.77 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  28.14 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.79 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  26.24 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.75 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.31 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  26.19 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  27.84 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  31.22 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.8 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  31.22 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.27 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.93 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  30.37 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  29.19 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26.15 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.41 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  27.44 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  25.47 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  27.75 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.91 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  26.32 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  26.32 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  26.89 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  26.89 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  25.94 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  26.34 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  30.73 
 
 
221 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  26.13 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  26.89 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  26.32 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.79 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.84 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  25.93 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.27 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.96 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  28.57 
 
 
243 aa  62.4  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.48 
 
 
210 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  26.42 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  25.47 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  25 
 
 
213 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  25 
 
 
213 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  26.61 
 
 
294 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  24.19 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.52 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.52 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.52 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.52 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  26.04 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  29.63 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  26.8 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.52 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  25.47 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  25.62 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  24.4 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  21.21 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  23.04 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.23 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  25 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  29.86 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  25.47 
 
 
209 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  24.89 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  19.82 
 
 
237 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.12 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  20.98 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  23.71 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  26.39 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  23.5 
 
 
236 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  25.74 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  22.22 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  23.98 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  20.42 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.51 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  21.36 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  22.03 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  23.39 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  24.87 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  26.18 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  21.72 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  21.03 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>