108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1147 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1147  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  732    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0295798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1581  hypothetical protein  52.15 
 
 
359 aa  334  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.41 
 
 
354 aa  301  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.592617  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.51 
 
 
349 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.44 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.04 
 
 
247 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.68 
 
 
263 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.51 
 
 
233 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.25 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  28.36 
 
 
259 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.98 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  46.15 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  46.15 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  26 
 
 
507 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.76 
 
 
268 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  36 
 
 
550 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  29.27 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.27 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.57 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.56 
 
 
226 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.54 
 
 
445 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  24.24 
 
 
363 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.72 
 
 
343 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.418818  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  22.55 
 
 
347 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  31.86 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.82 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  35.82 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  35.82 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0118  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.77 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.921505  normal  0.832944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.31 
 
 
238 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.62 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.88 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1809  hypothetical protein  30.77 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.188281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.6 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.915139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2342  protein of unknown function DUF1730  31.17 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.932969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.15 
 
 
227 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4256  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1100  hypothetical protein  27.82 
 
 
267 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4342  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298178  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183836  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3534  hypothetical protein  31.17 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  31.17 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  23.2 
 
 
229 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  35.38 
 
 
317 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00061  hypothetical protein  26.19 
 
 
321 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  35 
 
 
514 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  35 
 
 
514 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2662  domain of unknown function DUF1730  29.41 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1435  hypothetical protein  25.85 
 
 
265 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15136  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.42 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  25.74 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  29.87 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2385  hypothetical protein  29.41 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  23.39 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3132  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240229  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.26 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  36.92 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3598  hypothetical protein  29.41 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00061  hypothetical protein  35.38 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.73 
 
 
450 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0440  domain of unknown function DUF1730  36.92 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00797528  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25 
 
 
484 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  24.76 
 
 
480 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.19 
 
 
491 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  38.81 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1342  hypothetical protein  29.21 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.185892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1423  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.69 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.08 
 
 
442 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4019  hypothetical protein  26.24 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170373  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.38 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25 
 
 
474 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02610  hypothetical protein  23.84 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  31.03 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.87 
 
 
388 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3762  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.14 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.81 
 
 
380 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  31.17 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.38 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  30.77 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4582  domain of unknown function DUF1730  30.77 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  34.38 
 
 
380 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  32.31 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  32.31 
 
 
390 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.16 
 
 
386 aa  43.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.94 
 
 
379 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  25.12 
 
 
323 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  22.46 
 
 
373 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.81 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1045  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  29.23 
 
 
398 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  32.81 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  32.81 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  32.81 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  32.81 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0983  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.23 
 
 
404 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  32.05 
 
 
375 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3141  iron-sulfur cluster-binding protein  29.52 
 
 
182 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.81 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>