More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1786 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
78 aa  159  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  71.79 
 
 
79 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  71.79 
 
 
78 aa  116  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  71.79 
 
 
80 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  69.23 
 
 
78 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  72 
 
 
79 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  72 
 
 
79 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  71.43 
 
 
81 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  74.32 
 
 
82 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
76 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
76 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  70.51 
 
 
78 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 
80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 
80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  67.95 
 
 
80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 
80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  70.27 
 
 
80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
87 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
80 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
80 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
80 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
86 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
88 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
88 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
88 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
82 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
82 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
76 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  65.38 
 
 
82 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 
85 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  70.67 
 
 
80 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
79 aa  100  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  61.64 
 
 
83 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  56.58 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  64.86 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  57.89 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  55.26 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  55.07 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  55.41 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  58.11 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  54.79 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  57.75 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  52 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  52 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  59.42 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  49.33 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  49.32 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 
99 aa  77  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0059  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000129273  hitchhiker  1.52646e-17 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  52.11 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  55.71 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  56.52 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  53.42 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>