34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0413 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  40.35 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  40.32 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  32.79 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  33.16 
 
 		 242 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  32.95 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  33.52 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  30.99 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  29.67 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  30.99 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  32.63 
 
 		 204 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  35.88 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  33.16 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  31.55 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  31.76 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  31.68 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  30.69 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  24.6 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  33.33 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  25.26 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  37.11 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  28.12 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  29.68 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  27.06 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  28.67 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  28.76 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  29.44 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  29.44 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  56.25 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2497  TadE-like  25 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0206754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3495  hypothetical protein  23.88 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520499  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  29.49 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  54.29 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>