227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2056 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  100 
 
 
485 aa  978    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2005  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  39.64 
 
 
375 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
641 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  28.25 
 
 
639 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 
622 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
640 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 
634 aa  177  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  26.93 
 
 
646 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 
625 aa  173  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.79 
 
 
637 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.82 
 
 
633 aa  170  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.35 
 
 
642 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  26.77 
 
 
648 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  28.23 
 
 
486 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  28.5 
 
 
629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  28.74 
 
 
629 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.36 
 
 
478 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 
615 aa  163  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  31.01 
 
 
601 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28.02 
 
 
615 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.06 
 
 
600 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  28.84 
 
 
629 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  26.97 
 
 
626 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25.84 
 
 
624 aa  160  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  26.34 
 
 
625 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
618 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.79 
 
 
615 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.73 
 
 
625 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  25.38 
 
 
627 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  29.17 
 
 
633 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.03 
 
 
648 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.78 
 
 
622 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  25.87 
 
 
641 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  27.57 
 
 
629 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 
615 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  27.4 
 
 
626 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  26.63 
 
 
618 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  28.09 
 
 
480 aa  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  27.02 
 
 
615 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
615 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.02 
 
 
615 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.02 
 
 
615 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  24.94 
 
 
624 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  27.02 
 
 
615 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 
606 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  27.72 
 
 
606 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  28.81 
 
 
637 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  26.54 
 
 
620 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 
641 aa  149  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.8 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  26.77 
 
 
620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  26.77 
 
 
620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  26.96 
 
 
620 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  26.97 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  26.15 
 
 
626 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  26.44 
 
 
638 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.33 
 
 
635 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 
613 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  27.55 
 
 
625 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  27.25 
 
 
606 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.48 
 
 
649 aa  144  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  27.8 
 
 
611 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 
645 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.18 
 
 
649 aa  143  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  26.34 
 
 
663 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  27.84 
 
 
623 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.32 
 
 
601 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.32 
 
 
601 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.15 
 
 
485 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  29.73 
 
 
603 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  26.65 
 
 
628 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.58 
 
 
603 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  24.89 
 
 
639 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.34 
 
 
603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.54 
 
 
605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.36 
 
 
606 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.34 
 
 
603 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  28.81 
 
 
603 aa  136  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1634  hypothetical protein  32.36 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  29.34 
 
 
629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  28.67 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  28.33 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.08 
 
 
596 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  26.92 
 
 
608 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1400  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  31.47 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  28.73 
 
 
645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 
615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  28.73 
 
 
645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  26.55 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  28.81 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 
645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  25.57 
 
 
681 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 
617 aa  128  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  28.42 
 
 
622 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  29.08 
 
 
644 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  23.84 
 
 
615 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  25.27 
 
 
645 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  21.27 
 
 
650 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>