More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1598 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  291  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.62 
 
 
429 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  63.49 
 
 
133 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.73 
 
 
229 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.62 
 
 
162 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  54.96 
 
 
228 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.85 
 
 
207 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.31 
 
 
257 aa  146  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.31 
 
 
450 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.08 
 
 
223 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.08 
 
 
281 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.49 
 
 
138 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  56.2 
 
 
126 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  55.73 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.54 
 
 
165 aa  141  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.96 
 
 
139 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
138 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
138 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
138 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
138 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
138 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
138 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
139 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  56.69 
 
 
139 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.44 
 
 
139 aa  139  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.74 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.54 
 
 
278 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.15 
 
 
139 aa  137  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.36 
 
 
223 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.36 
 
 
223 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.62 
 
 
162 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  56 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.8 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.62 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.6 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.38 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.6 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.2 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.65 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.54 
 
 
138 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.93 
 
 
147 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0227  DnaK suppressor protein DksA  48.76 
 
 
151 aa  120  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.143062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  51.54 
 
 
134 aa  119  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2819  RNA polymerase-binding transcription factor  48.76 
 
 
151 aa  120  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.02941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.76 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1164  RNA polymerase-binding transcription factor  47.93 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00894629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.07 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.74 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.21 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.93 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3114  RNA polymerase-binding transcription factor  47.93 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0231493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.59 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  52.21 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1939  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.62 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42640  RNA polymerase binding protein DksA  46.72 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.105027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1032  RNA polymerase-binding transcription factor  48.76 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0218805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1023  DnaK suppressor protein  48.74 
 
 
136 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.38 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.4 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  51.54 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.38 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  42.96 
 
 
143 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3985  RNA polymerase-binding transcription factor  46.28 
 
 
151 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000239354  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.74 
 
 
146 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.72 
 
 
145 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00144  DNA-binding transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3457  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0136  RNA polymerase-binding transcription factor  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000300013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3514  RNA polymerase-binding transcription factor  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000935377  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0154  RNA polymerase-binding transcription factor  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0149  RNA polymerase-binding transcription factor  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0148  RNA polymerase-binding transcription factor  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000273463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0156  RNA polymerase-binding transcription factor  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000187582  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00143  hypothetical protein  47.11 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000224196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.4 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.38 
 
 
138 aa  115  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.94 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  49.6 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  47.06 
 
 
146 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.72 
 
 
144 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0218  RNA polymerase-binding transcription factor  45.45 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.236664  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0202  RNA polymerase-binding transcription factor  45.45 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0203  RNA polymerase-binding transcription factor  45.45 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0214  RNA polymerase-binding transcription factor  45.45 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.748319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0220  RNA polymerase-binding transcription factor  45.45 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000337551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4691  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.56 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  51.59 
 
 
157 aa  113  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3129  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.63 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0353439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>