More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0122 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  100 
 
 		 628 aa  1268    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  65.55 
 
 		 599 aa  717    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  58.76 
 
 		 605 aa  684    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  49.09 
 
 		 600 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  49.23 
 
 		 611 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  45.95 
 
 		 583 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  45.94 
 
 		 603 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  42.38 
 
 		 600 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  43.26 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  38.77 
 
 		 625 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  44.3 
 
 		 583 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  43.32 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  41.64 
 
 		 596 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  42.52 
 
 		 586 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  42.44 
 
 		 596 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 599 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  37.35 
 
 		 594 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  41.4 
 
 		 585 aa  349  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  37.22 
 
 		 600 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  36.89 
 
 		 613 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  33.81 
 
 		 571 aa  330  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  34.13 
 
 		 614 aa  329  8e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.44 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  32.11 
 
 		 601 aa  323  5e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  33.1 
 
 		 610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.95 
 
 		 564 aa  297  4e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  29.28 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.1 
 
 		 564 aa  271  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  37.36 
 
 		 626 aa  270  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 		 564 aa  263  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  35.61 
 
 		 606 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.73 
 
 		 564 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  26.89 
 
 		 552 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  27.88 
 
 		 586 aa  250  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  32.28 
 
 		 611 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.35 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  32.09 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  30.72 
 
 		 607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  35.57 
 
 		 603 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.44 
 
 		 610 aa  230  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  32.7 
 
 		 746 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  30.34 
 
 		 676 aa  227  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  27.83 
 
 		 576 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  31.56 
 
 		 613 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  31.79 
 
 		 610 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  30.16 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  34.57 
 
 		 600 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.6 
 
 		 600 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  32.2 
 
 		 589 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.2 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  28.76 
 
 		 612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.98 
 
 		 582 aa  217  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.33 
 
 		 586 aa  217  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.2 
 
 		 610 aa  216  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  35.31 
 
 		 596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.69 
 
 		 582 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.69 
 
 		 582 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.69 
 
 		 582 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.09 
 
 		 581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 596 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  31.42 
 
 		 596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 631 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  29.02 
 
 		 610 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.61 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.61 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.61 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.61 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  32.97 
 
 		 588 aa  212  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.61 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  31.88 
 
 		 605 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.13 
 
 		 597 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.09 
 
 		 577 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.77 
 
 		 587 aa  211  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.98 
 
 		 590 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  28.48 
 
 		 599 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  31.55 
 
 		 613 aa  211  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.35 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 		 592 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  27.79 
 
 		 616 aa  209  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  29.91 
 
 		 610 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.72 
 
 		 575 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  30.92 
 
 		 597 aa  209  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.66 
 
 		 584 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  30.04 
 
 		 634 aa  209  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2774  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  31.19 
 
 		 590 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.41147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.4 
 
 		 592 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.03 
 
 		 574 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.38 
 
 		 639 aa  208  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  30.48 
 
 		 594 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  46.26 
 
 		 591 aa  207  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>