More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1400 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  746    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  69.02 
 
 		 371 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  69.4 
 
 		 370 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  67.89 
 
 		 370 aa  508  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  66.03 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  54.62 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  52.3 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  51.08 
 
 		 367 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  51.08 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  49.73 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  49.46 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  50 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  46.34 
 
 		 369 aa  342  8e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  43.09 
 
 		 365 aa  318  7.999999999999999e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  44.74 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  46.24 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  44.77 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  45.97 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  44.89 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  45.45 
 
 		 367 aa  301  9e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  43.41 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  43.58 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  44.26 
 
 		 374 aa  295  6e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  41.88 
 
 		 410 aa  292  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  45.7 
 
 		 370 aa  292  6e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  41.4 
 
 		 367 aa  286  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  45.79 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  41.22 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  44.11 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  40.51 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  29 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  27.54 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.23 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  30.27 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  27.15 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.23 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  26.98 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  27.76 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  25.61 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  26.32 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  32.57 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  31.93 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  44.19 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  27.48 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  31.51 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  41.38 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.44 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.43 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  26.72 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  42.17 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  41.28 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.22 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  38.14 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  44.44 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  44.16 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  43.53 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.68 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  42.68 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.78 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  34.51 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.25 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  40 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  38.75 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  34.95 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.29 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.44 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  40 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  40.96 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.15 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.04 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.14 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.96 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  42.17 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.56 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.7 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  37.86 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  29.3 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  38.75 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  42.17 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  37.1 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  36.79 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  43.9 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  35.11 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.77 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  26.95 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.87 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  38.71 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.98 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  39.76 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.04 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  37.62 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.59 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  27.62 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.64 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  36.79 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.98 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  40 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  33.02 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.53 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>