More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1122 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  54.53 
 
 		 896 aa  995    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  100 
 
 		 879 aa  1814    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  55.68 
 
 		 880 aa  1025    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.4 
 
 		 885 aa  1012    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  57.74 
 
 		 878 aa  1064    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  51.17 
 
 		 393 aa  405  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  48.08 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  48.33 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 412 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.29 
 
 		 409 aa  317  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  37.66 
 
 		 667 aa  317  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40 
 
 		 408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.2 
 
 		 418 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 415 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.32 
 
 		 406 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.07 
 
 		 406 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 392 aa  302  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 414 aa  300  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.29 
 
 		 414 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  40 
 
 		 414 aa  297  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 412 aa  296  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.53 
 
 		 443 aa  295  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  38.24 
 
 		 416 aa  293  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  39.55 
 
 		 420 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 420 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 406 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  41.07 
 
 		 406 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  41.07 
 
 		 406 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  41.07 
 
 		 406 aa  290  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  41.07 
 
 		 406 aa  290  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  38 
 
 		 416 aa  290  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  41.07 
 
 		 406 aa  290  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  41.07 
 
 		 406 aa  290  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  41.06 
 
 		 420 aa  290  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.07 
 
 		 406 aa  290  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  41.28 
 
 		 393 aa  289  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  40.82 
 
 		 406 aa  288  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  40.82 
 
 		 406 aa  288  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  41.07 
 
 		 406 aa  288  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 411 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  41.58 
 
 		 417 aa  286  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.6 
 
 		 449 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.24 
 
 		 435 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  39.11 
 
 		 423 aa  285  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  36.78 
 
 		 425 aa  285  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.2 
 
 		 421 aa  283  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.75 
 
 		 420 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  39.33 
 
 		 441 aa  283  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  39.7 
 
 		 405 aa  282  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  39.76 
 
 		 424 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.5 
 
 		 420 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.89 
 
 		 417 aa  281  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  40.69 
 
 		 425 aa  280  9e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.11 
 
 		 419 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.27 
 
 		 433 aa  280  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.75 
 
 		 419 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  39.04 
 
 		 421 aa  280  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  40.72 
 
 		 395 aa  278  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.75 
 
 		 404 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.31 
 
 		 444 aa  278  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  39.65 
 
 		 434 aa  278  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  38.69 
 
 		 429 aa  277  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.97 
 
 		 414 aa  277  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.35 
 
 		 409 aa  276  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.22 
 
 		 421 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 408 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.36 
 
 		 415 aa  276  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.27 
 
 		 415 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  39.24 
 
 		 414 aa  274  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 428 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.75 
 
 		 418 aa  273  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.93 
 
 		 425 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  33.2 
 
 		 796 aa  273  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.35 
 
 		 408 aa  273  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.65 
 
 		 429 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  36.65 
 
 		 417 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.9 
 
 		 412 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  36.62 
 
 		 410 aa  272  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.25 
 
 		 404 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.41 
 
 		 417 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.56 
 
 		 662 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.9 
 
 		 429 aa  273  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.83 
 
 		 416 aa  272  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  36.96 
 
 		 429 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.8 
 
 		 408 aa  272  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.77 
 
 		 441 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.36 
 
 		 657 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.59 
 
 		 417 aa  271  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.89 
 
 		 451 aa  271  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.21 
 
 		 664 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.32 
 
 		 630 aa  270  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  38.16 
 
 		 410 aa  270  8.999999999999999e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.46 
 
 		 673 aa  270  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 417 aa  270  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.91 
 
 		 414 aa  270  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 417 aa  270  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.77 
 
 		 415 aa  270  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  35.66 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.84 
 
 		 419 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>