More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4175 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  98.79 
 
 
248 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  82.59 
 
 
248 aa  407  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  52 
 
 
249 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  50.8 
 
 
252 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  46 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  48.99 
 
 
253 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  43.7 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  42.13 
 
 
253 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  42.13 
 
 
253 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  36.68 
 
 
269 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
263 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  36.78 
 
 
265 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
267 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  33.33 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1967  methyltransferase type 11  34.66 
 
 
274 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527194  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4115  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  33.2 
 
 
272 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1424  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2439  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  35 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  42.86 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.63 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.89 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  32.76 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  32.24 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  32.24 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.24 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  32.24 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  31.58 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  31.58 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  26.38 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  28.57 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.71 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.41 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  35.14 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.82 
 
 
200 aa  62.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.43 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  33.07 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.78 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.83 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
277 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  34.23 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  34.23 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
260 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
266 aa  58.9  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>