130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2603 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
286 aa  595  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  51.06 
 
 
286 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  51.41 
 
 
285 aa  314  9e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  51.94 
 
 
285 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  51.58 
 
 
302 aa  308  9e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
381 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
295 aa  215  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  39.18 
 
 
301 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  39.64 
 
 
288 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  38.06 
 
 
303 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
302 aa  192  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  34.57 
 
 
304 aa  175  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  37.72 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  35.74 
 
 
316 aa  155  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  36.6 
 
 
306 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  33.68 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  36.23 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  33.45 
 
 
292 aa  145  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  32.77 
 
 
294 aa  142  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  32.18 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  34.72 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  32.18 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  31.83 
 
 
298 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  29.21 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  29.86 
 
 
422 aa  132  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  30.85 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  31.82 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  29.78 
 
 
526 aa  125  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  30.26 
 
 
405 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  32.29 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  35.21 
 
 
291 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  32.8 
 
 
287 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  31.02 
 
 
334 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
306 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  30.32 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
261 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  28.51 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  27.23 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  28.92 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  26.39 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  29.61 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  29.11 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  27.05 
 
 
254 aa  79  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  28.44 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  27.75 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  27.19 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  29.3 
 
 
622 aa  72.8  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  25.56 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  31.07 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  29.95 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  29.19 
 
 
411 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  25.11 
 
 
375 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  29.61 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  24.88 
 
 
495 aa  65.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  29.91 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  29.91 
 
 
412 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  30.39 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  31.94 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  28.99 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  29.33 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  28.99 
 
 
285 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  28.99 
 
 
285 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  29.33 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  29.33 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  29.33 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  30.14 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  28.5 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  29.33 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  27.98 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  28.99 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  30 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  31.71 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  30.93 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  29.05 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  30.43 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  28.71 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  29.11 
 
 
285 aa  59.3  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  29.67 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  29.67 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  30.19 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  28.23 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  28.23 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  28.7 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  23.83 
 
 
558 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  27.75 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  28.02 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  25.81 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  28.97 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  31.79 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>