44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2543 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  631  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  48.52 
 
 
297 aa  291  7e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  48.32 
 
 
296 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  47.42 
 
 
296 aa  267  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  38.96 
 
 
307 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0026  cysteine-rich small domain protein  31.94 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  38.16 
 
 
200 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  32.38 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.75 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  38.26 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.59 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1233  hypothetical protein  45 
 
 
122 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0722  hypothetical protein  43.33 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.16 
 
 
498 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1244  hypothetical protein  43.33 
 
 
122 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1442  hypothetical protein  45 
 
 
122 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.263139  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0934  hypothetical protein  45 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  29.38 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  33.67 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.81 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  32.32 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  31.28 
 
 
494 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  30.69 
 
 
229 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  32.14 
 
 
234 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  37.39 
 
 
180 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  28.12 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1533  hypothetical protein  34.16 
 
 
337 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00901937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  30.77 
 
 
700 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  31.49 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  28.57 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  30.77 
 
 
268 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  30.77 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  43.02 
 
 
175 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  27.59 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  27.07 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  27.23 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  26.84 
 
 
385 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  32.84 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  31.58 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  27.23 
 
 
393 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  33.1 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  30.85 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  30.54 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  23.76 
 
 
241 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>