90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0281 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0281  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  100 
 
 
423 aa  861    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0757727  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  39.95 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  32.07 
 
 
430 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.06 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.88 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  23.26 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  24.23 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  22.38 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  24.1 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  25.63 
 
 
511 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  22.58 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  24.03 
 
 
512 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  24.51 
 
 
516 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  23.45 
 
 
460 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.86 
 
 
448 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.51 
 
 
508 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.87 
 
 
531 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.07 
 
 
532 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0551  nitrogenase component I, alpha chain  25.22 
 
 
486 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.39708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  23.32 
 
 
459 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0163  hypothetical protein  22.3 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.11 
 
 
530 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.11 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.15 
 
 
531 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  22.08 
 
 
458 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.58 
 
 
522 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  22.51 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.63 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.77 
 
 
524 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  22.99 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.93 
 
 
936 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  23.1 
 
 
448 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22 
 
 
509 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  21.93 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.41 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.24 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.14 
 
 
517 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  21.79 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.24 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  23.31 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.22 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.99 
 
 
480 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  21.09 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1943  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.8 
 
 
388 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  25.81 
 
 
501 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  20.93 
 
 
466 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  21.61 
 
 
458 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.91 
 
 
525 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2081  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.68 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0661  nitrogenase alpha chain  24.1 
 
 
476 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.949804  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.1 
 
 
525 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1313  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.21 
 
 
428 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.22 
 
 
526 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.18 
 
 
530 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0101  nitrogenase alpha chain  24.01 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299285  normal  0.0821221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.5 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0235  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.33 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.74 
 
 
544 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.32 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.91 
 
 
539 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  24.05 
 
 
502 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.66 
 
 
467 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  20.38 
 
 
508 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  24.16 
 
 
731 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  25.93 
 
 
459 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.75 
 
 
541 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.49 
 
 
508 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.41 
 
 
546 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.85 
 
 
542 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0062  nitrogenase alpha chain  23.65 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1566  nitrogenase  22.53 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.54 
 
 
536 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0313  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.58 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000260706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.91 
 
 
542 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  26.02 
 
 
546 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1800  nitrogenase alpha chain  23.51 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.515019  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.01 
 
 
540 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.47 
 
 
535 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  23.28 
 
 
482 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.71 
 
 
508 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  20.51 
 
 
410 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.32 
 
 
541 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.02 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.34 
 
 
546 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1050  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.34 
 
 
477 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.55 
 
 
424 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2592  Nitrogenase  23.22 
 
 
511 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  21.02 
 
 
458 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1013  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.88 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153138  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  24.07 
 
 
461 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>