225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2081 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2081  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  100 
 
 
376 aa  759    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1943  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  49.87 
 
 
388 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0235  oxidoreductase/nitrogenase component 1  47.18 
 
 
387 aa  343  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0163  hypothetical protein  44.74 
 
 
377 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  24.34 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1354  Nitrogenase  27 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00134984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  26.92 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  26.94 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  28.81 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  28.36 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.64 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.11 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1028  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.02 
 
 
504 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  20.35 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.63 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  31.15 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.83 
 
 
489 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  25.86 
 
 
459 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.54 
 
 
487 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.71 
 
 
448 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  23.81 
 
 
460 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.6 
 
 
460 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.15 
 
 
465 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.32 
 
 
487 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.88 
 
 
489 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.93 
 
 
509 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.78 
 
 
448 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  24.94 
 
 
456 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.72 
 
 
489 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.2 
 
 
478 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.81 
 
 
487 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0841  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.11 
 
 
462 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  27.72 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.49 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  25 
 
 
463 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2003  nitrogenase  25.48 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.577427  normal  0.745673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  22.43 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.01 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2703  nitrogen fixation protein NifH/NifE  25 
 
 
746 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.5 
 
 
512 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  22.2 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.52 
 
 
453 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3538  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.97 
 
 
460 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.52 
 
 
489 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.36 
 
 
513 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  26.2 
 
 
489 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.22 
 
 
430 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3992  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.13 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.45 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  23.4 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.49 
 
 
518 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  21.85 
 
 
919 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.66 
 
 
523 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25 
 
 
917 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.62 
 
 
918 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.16 
 
 
510 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  23.68 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.53 
 
 
522 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0680  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.72 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  22.92 
 
 
461 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.87 
 
 
513 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  26.82 
 
 
456 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.18 
 
 
522 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.76 
 
 
453 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.88 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  24.22 
 
 
474 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.4 
 
 
480 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.92 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  23.54 
 
 
915 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.37 
 
 
506 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1533  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.33 
 
 
453 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.936667  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  27.63 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  22.7 
 
 
462 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.49 
 
 
519 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.44 
 
 
905 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  22.4 
 
 
462 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.28 
 
 
520 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1250  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  28.57 
 
 
455 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.3 
 
 
460 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.4 
 
 
480 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.66 
 
 
487 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.67 
 
 
510 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  24.6 
 
 
519 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.2 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5056  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  26.43 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.28 
 
 
519 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.41 
 
 
518 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0537  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  29.29 
 
 
455 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.27 
 
 
506 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  23.8 
 
 
919 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0670  hypothetical protein  31.82 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1053  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  27.08 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.91 
 
 
476 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1013  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  21.32 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153138  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.81 
 
 
511 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2189  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.29 
 
 
943 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.235442 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.27 
 
 
516 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1209  vanadium nitrogenase-associated related protein N  30.11 
 
 
366 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  23.36 
 
 
509 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6877  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.61 
 
 
489 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>