107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4659 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  83.51 
 
 		 91 aa  137  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  67.53 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  67.01 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  67.01 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  67.01 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  64.1 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  73.77 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  61.97 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  54.84 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  50.65 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  63.49 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  65.38 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  67.21 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  52.24 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  57.38 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  50 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  62.03 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  42.42 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  65 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  46.99 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  54.1 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  55 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  52.11 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  42.62 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  34.83 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  30.77 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  30.77 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  31.94 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  42.62 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  45.1 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  38.81 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  44.68 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  45.28 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  39.39 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  42.62 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  34.43 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  40.98 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  36.73 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  33.9 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  35.19 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  38.18 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  36.51 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3459  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  41.07 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  42.62 
 
 		 99 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  37.88 
 
 		 82 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  50 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  36.84 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 97 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 92 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 108 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  35.19 
 
 		 108 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  35.19 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  35.44 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  42 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  35.19 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  35.44 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  35.19 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  35.44 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  38.18 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  42.37 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  35.44 
 
 		 84 aa  40.8  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  56.25 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  46.67 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  51.61 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  30.65 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>