177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0244 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  100 
 
 		 101 aa  206  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  66.67 
 
 		 100 aa  130  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  60.67 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  53.93 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  52 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  57.89 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  55.43 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  51.69 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  53 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0634  transcription factor WhiB  59.77 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  50 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  52.38 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  47.87 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  51.19 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  52.75 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6542  transcription factor WhiB  51.55 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  47.83 
 
 		 102 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  53.47 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3057  transcription factor WhiB  66.67 
 
 		 99 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  54.67 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  46.46 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  50.52 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  45.92 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  44.21 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  45.36 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  42.68 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  42.68 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  42.35 
 
 		 99 aa  67  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  42.35 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  43.53 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  43.59 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3617  transcription factor WhiB  38.16 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.844953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  39.77 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  38.27 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  40.66 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  45.59 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  42.42 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  45.33 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  38.03 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  37.86 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  38.96 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  40.96 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  40 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  40.7 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  41.03 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  37.66 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  37.66 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1794  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  40 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  38.36 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  34.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  34.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  41.86 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  36.47 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  40.28 
 
 		 83 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  36.78 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  40.28 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  39.29 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  36.84 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  34.44 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  39.13 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  36.9 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>