191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  100 
 
 		 101 aa  207  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  85.39 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  84.27 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  66.29 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  61.8 
 
 		 160 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  75.26 
 
 		 100 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  61.8 
 
 		 99 aa  120  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3057  transcription factor WhiB  72.73 
 
 		 99 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  56.18 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  56.82 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  53 
 
 		 99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  57.65 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  55.68 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  55.68 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  52.63 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  53.47 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  56.82 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0634  transcription factor WhiB  61.36 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  55.21 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  61.36 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  55.42 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6542  transcription factor WhiB  57.78 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  48.86 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  53.75 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  53.41 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  53.41 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  45.68 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  43.18 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3617  transcription factor WhiB  43.42 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.844953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  50 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  45.12 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  49.28 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  48.61 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  48.53 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  47.14 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  46.48 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1794  transcription factor WhiB  53.7 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  47.89 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  49.35 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  45.07 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  43.37 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  44.12 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  45.07 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  40.7 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  40.7 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  37.35 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  40.24 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  37.66 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  45.35 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  45.59 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  42.5 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  41.46 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  41.56 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  44.12 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  43.48 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  41.98 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  34.12 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  42.86 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  40.7 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  41.54 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>