191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  100 
 
 		 95 aa  197  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  71.62 
 
 		 83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  64.86 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  60.98 
 
 		 84 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  63.51 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  63.51 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  60.98 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  63.51 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  63.51 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  62.67 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  63.51 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  59.49 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  63.51 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  59.46 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  64.29 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  64.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  63.16 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  61.33 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  58.97 
 
 		 85 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  58.11 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  55.56 
 
 		 82 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  62.86 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  60.29 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  59.09 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  60.61 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  55.71 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  60.61 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  59.09 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  59.09 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  57.58 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  57.58 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  56.06 
 
 		 82 aa  89.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  56.06 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  57.58 
 
 		 87 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  56.06 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  53.03 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  58.46 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  52.78 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  52.78 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  50.67 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  50.67 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  44.59 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  49.33 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  49.35 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  49.32 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  47.37 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  50.68 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  53.62 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  49.3 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  50 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  49.3 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  49.3 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  48.61 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  46.58 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  44.3 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  48.61 
 
 		 123 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  50.7 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  49.3 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  47.89 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  48.57 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  47.89 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  47.89 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  47.89 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  47.89 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  50 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  52.38 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  47.76 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  47.76 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  47.76 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  43.08 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  45.95 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  48.39 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  49.28 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  41.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  48.39 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  46.27 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  46.27 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  50.79 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  44.58 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>