187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0328 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  45.24 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  44.59 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  43.9 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  45.59 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  42.47 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  46.27 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  46.75 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  46.88 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  46.88 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  46.88 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  44.16 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  39.33 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  46.27 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  45.21 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  50.88 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  41.77 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  49.25 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  45.57 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  47.46 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  43.59 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  45.61 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  47.76 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  40.85 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  40.24 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  45.61 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  45.61 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  40.66 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  44.83 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  44.3 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  42.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  46.55 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  43.48 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  46.55 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  45.61 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  45.59 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  41.18 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  43.08 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  46.03 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  45.21 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  45.83 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  42.03 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  42.86 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  39.77 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  39.77 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  45.16 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  37.97 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  41.54 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  36.14 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  40.79 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  44.71 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  37.7 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  40.91 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  40.48 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>