196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6331 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  85.71 
 
 		 95 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  79.07 
 
 		 84 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  82.43 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  85.14 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  85.14 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  85.14 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  90.14 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  75.29 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  84.93 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  88.57 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  78.75 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  85.14 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  85.71 
 
 		 85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  88.24 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  78.08 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  83.58 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  85.53 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  83.78 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  88.14 
 
 		 210 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  68.18 
 
 		 99 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  72.15 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  67.35 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  88.52 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  85.92 
 
 		 213 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  74.65 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  74.71 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  88.57 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  69.62 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  68.49 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  85.96 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  75.64 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  77.92 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  75 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  68.12 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  77.19 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  64.71 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  51.43 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  48 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  50.77 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3459  transcription factor WhiB  50 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  49.32 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  50 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  47.95 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  48.53 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  48 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  49.33 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  45.95 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  47.76 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  44.29 
 
 		 101 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  47.3 
 
 		 84 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  43.24 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  49.28 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  45.83 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  48 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  45.33 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  52.05 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  42.67 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  45.95 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  38.81 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  45.95 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  39.73 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  48.28 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  48.28 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  43.21 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  43.21 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  43.21 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  40.26 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  44.3 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  47.46 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  46.05 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  46.55 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  37.18 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  43.66 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  41.33 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  41.98 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  41.98 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>