163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0239 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  100 
 
 		 90 aa  177  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  43.37 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  43.37 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  45.33 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  43.37 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  43.37 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  43.37 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  44.19 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  44.71 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  42.17 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  40.7 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  44 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  44.58 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  46.75 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  40.51 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  40.48 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  40.51 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  47.62 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  41.86 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  45.07 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  39.24 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  45.07 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  41.03 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  43.84 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5190  transcription factor WhiB  40.51 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188253  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  42.17 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  45.07 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  38.67 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  44.3 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  41.77 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  42.67 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0634  transcription factor WhiB  49.33 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  42.68 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  44.74 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  39.77 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  40 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  45.33 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  36.14 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  43.42 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  37.35 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  47.5 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  39.29 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  41.56 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  36.05 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  37.8 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  41.56 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  42.25 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  39.24 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  45.35 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  37.35 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  41.98 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  41.46 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  46.05 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  38.03 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  37.33 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  39.02 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  40.85 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  40.3 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 213 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6542  transcription factor WhiB  41.98 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  41.56 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  40.79 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  49.25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>