173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1816 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  63.16 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  60 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  60 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  60 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  60 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  58.95 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  57.89 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  58.06 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  56.84 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  56.82 
 
 		 99 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  60.24 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  53.19 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  54.26 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  60.23 
 
 		 98 aa  99.4  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  57.45 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  53.85 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  61.29 
 
 		 100 aa  97.1  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6542  transcription factor WhiB  59.57 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  55.32 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  51.58 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  47.87 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0634  transcription factor WhiB  57.83 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  50.59 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  53.19 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  50 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  48.94 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  55.42 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  43.82 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3057  transcription factor WhiB  56.18 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  45.56 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  51.43 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  50.72 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  50.72 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3617  transcription factor WhiB  45.71 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.844953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  49.28 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  52.63 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  42.53 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  40 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  45 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  43.68 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  46.75 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  40.45 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  47.62 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  47.62 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  37.66 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  46.05 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  46.91 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  40.45 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  43.66 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  41.57 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  43.96 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  43.96 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  43.96 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  41.57 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  44.16 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  42.17 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  44.74 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  40 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  47.62 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  37.66 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  40 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  40 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1794  transcription factor WhiB  50 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  46.03 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  40.28 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  46.03 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  40.28 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  40.28 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  35.53 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  40.51 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>