167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1506 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  100 
 
 
96 aa  198  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  95.83 
 
 
96 aa  193  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  93.75 
 
 
96 aa  190  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  93.75 
 
 
96 aa  190  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  93.75 
 
 
96 aa  190  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  81.37 
 
 
102 aa  174  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  81.91 
 
 
98 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  80.85 
 
 
98 aa  143  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  60.64 
 
 
99 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  62.92 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  60 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  61.11 
 
 
98 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  59.57 
 
 
99 aa  120  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  67.42 
 
 
100 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  57.95 
 
 
99 aa  116  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6542  transcription factor WhiB  67.02 
 
 
111 aa  116  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  57.89 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  51.55 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  60.23 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  58.33 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  52.22 
 
 
93 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0634  transcription factor WhiB  57.3 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  50 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  51.16 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  52.58 
 
 
100 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  55.67 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  55.68 
 
 
101 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  56.82 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  48.72 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  50.6 
 
 
114 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3057  transcription factor WhiB  56.82 
 
 
99 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3617  transcription factor WhiB  49.3 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.844953  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  47.44 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  52.17 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  50.72 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  48.53 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  48.15 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  48.15 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  48.15 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  48.15 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  45.57 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  42.68 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  48.72 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  46.91 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  45.68 
 
 
84 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  48.68 
 
 
85 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  48.68 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  51.47 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  47.44 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  47.37 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  46.48 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  53.12 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  46.15 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  47.44 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  47.22 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  39.71 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  47.22 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1794  transcription factor WhiB  51.85 
 
 
70 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  48.53 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  44.87 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  43.06 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  44 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  43.04 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  46.67 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  47.83 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  47.06 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  45.59 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  47.06 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  41.98 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  42.86 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  45.59 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  40.74 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  38.89 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  41.33 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  40.26 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  40.66 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  42.11 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  44.12 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  43.06 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  41.33 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  44.12 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  44.12 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  44.12 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  41.18 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  41.67 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  42.65 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  42.25 
 
 
97 aa  53.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  38.16 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  41.67 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  39.51 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  40 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  40 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  40 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  34.67 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  38.75 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  35.71 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  41.18 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  38.46 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>