183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1482 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  100 
 
 		 122 aa  245  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  88.52 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  41.05 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  40.22 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  39.76 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  40.24 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  45.95 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  47.76 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  42.65 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  47.76 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  37.65 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  40 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  42.67 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  47.76 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3617  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.844953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  40 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  43.94 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  38.03 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  39.74 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  38.27 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  45.59 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  34.02 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  40 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  40 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  40 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  40 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  35.87 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  40.85 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  42.67 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  40 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  40 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  36.56 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  39.76 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  41.56 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  42.65 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  39.76 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  42.67 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  35.9 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  44.12 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  32.98 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  39.13 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  39.19 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  39.13 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  40.3 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>