154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3938 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  100 
 
 
103 aa  209  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  83.52 
 
 
103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  76.84 
 
 
118 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  76.84 
 
 
118 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  76.84 
 
 
118 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  78.26 
 
 
118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  76.6 
 
 
118 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  72.63 
 
 
118 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  69.32 
 
 
101 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  61.9 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  64.2 
 
 
107 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  62.96 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  60.71 
 
 
116 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  67.9 
 
 
102 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  64.63 
 
 
102 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  59.09 
 
 
157 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  64.63 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  67.09 
 
 
106 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  67.09 
 
 
106 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  62.07 
 
 
98 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  64.71 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  65.82 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  64.71 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  60.49 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  58.82 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  55.68 
 
 
103 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  55.84 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3098  transcription factor WhiB  63.64 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.918982  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0605  transcription factor WhiB  55.84 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  43.06 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  40.85 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  39.44 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  45.21 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  45.21 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  45.21 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  45.21 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  45.21 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  43.84 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  46.58 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  46.38 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  46.38 
 
 
84 aa  58.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  41.43 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  39.73 
 
 
83 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  41.1 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  39.39 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  40.28 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  43.66 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  39.44 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  40.91 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  40.79 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  43.75 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  40.91 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  40.91 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  38.81 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  38.89 
 
 
102 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  40.3 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  40.3 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  40.3 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  43.06 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  40.79 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  39.19 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  41.67 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  40.85 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  38.1 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  34.18 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  40.54 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  40.54 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  42.42 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  38.71 
 
 
106 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  39.44 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  42.03 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  37.5 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  37.1 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  38.55 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  41.1 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  36.51 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  39.51 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  35.94 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  34.44 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  37.5 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  32.91 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  35.38 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  40.58 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  37.5 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  43.08 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  40.3 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  35.94 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  37.29 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  32.81 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  34.83 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  32.93 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  38.6 
 
 
213 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  39.13 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  39.39 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
96 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  36.84 
 
 
112 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>