172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5577 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  50.62 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  52.44 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  54.93 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  53.42 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  53.42 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  49.4 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  52.78 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  53.52 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  52.11 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  46.25 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  53.52 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  45.68 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  45.68 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  45.68 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  52.11 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  50.7 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  56.72 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  52.11 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  49.37 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  49.37 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  50.7 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  52.11 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  52.24 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  51.52 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  50.7 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  53.03 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  49.3 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  48.05 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  50 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  51.52 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  50.75 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  51.52 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  48.48 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  43.59 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  37.08 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  42.47 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  41.67 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  40 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  35.87 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  37.65 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  36.47 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  44.16 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  40.7 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04680  Transcription factor WhiB  38.82 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0245221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  37.18 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  40 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  38.1 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  37.18 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3014  transcription factor WhiB  34.04 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371665  normal  0.0294243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  38.37 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  38.67 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  36.9 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  35.9 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  40 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  34.57 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  42.42 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  39.73 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  35.53 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  35.56 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  33.72 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  40.58 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  40.58 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>