200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5494 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  100 
 
 		 90 aa  188  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  56.25 
 
 		 83 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  56.25 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  56.25 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  55.71 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  53.75 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  58.21 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  54.29 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  56.72 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  59.7 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  54.29 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  56.72 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  50.6 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  53.75 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  54.29 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  53.73 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  56.72 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 84 aa  83.6  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 84 aa  83.6  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 84 aa  83.6  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  52.86 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  55.22 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  51.47 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  52.86 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  52.86 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  52.86 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  48.57 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  51.25 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  52.24 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  52.17 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  52.24 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  52.24 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  53.73 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  51.43 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  52.24 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  50.75 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  49.25 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  49.25 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  46.97 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  40.45 
 
 		 100 aa  67  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  43.9 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  42.53 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  40.48 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  44.59 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  44.59 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  45.71 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  43.48 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  45.31 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  45.07 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  44.29 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  46.27 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  44.62 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  43.59 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5190  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188253  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  41.77 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  36.14 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  44.78 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  44.78 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  42.65 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  41.79 
 
 		 96 aa  57  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  43.08 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  33.71 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  37.78 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  51.85 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  39.74 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  38.75 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>