177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3694 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  100 
 
 
85 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  78.05 
 
 
82 aa  136  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  77.38 
 
 
84 aa  136  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  81.01 
 
 
83 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  86.11 
 
 
84 aa  133  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  75 
 
 
83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  91.04 
 
 
84 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  75.95 
 
 
83 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  79.73 
 
 
85 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  78.38 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  75 
 
 
84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  75 
 
 
84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  75 
 
 
84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  75 
 
 
84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  75 
 
 
84 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  78.38 
 
 
85 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  76.92 
 
 
85 aa  127  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  86.57 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  71.25 
 
 
84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  74.68 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  86.57 
 
 
83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  83.58 
 
 
82 aa  123  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  83.58 
 
 
82 aa  122  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  83.58 
 
 
82 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  74.03 
 
 
84 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  82.09 
 
 
87 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  82.09 
 
 
82 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  80.6 
 
 
82 aa  120  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  75 
 
 
83 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  79.1 
 
 
82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  72.97 
 
 
82 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  75 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  70.27 
 
 
82 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  73.61 
 
 
84 aa  115  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  70.83 
 
 
82 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  65.82 
 
 
90 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  75.76 
 
 
83 aa  113  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  74.63 
 
 
82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  51.85 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  48.61 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  57.58 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  48.72 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  49.25 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  45.83 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  45.95 
 
 
85 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  44.59 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  46.48 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  45.83 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  46.48 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  46.48 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  43.84 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  43.24 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  45.57 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  46.03 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  43.84 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  43.24 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3014  transcription factor WhiB  40.7 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371665  normal  0.0294243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  45.07 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  45.07 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  45.07 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  47.44 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  44.19 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  50.72 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  43.66 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  43.66 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  43.06 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  43.28 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  43.66 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  43.66 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  42.35 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  42.25 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  47.83 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  45.45 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  46.38 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  41.46 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
210 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  42.19 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  46.38 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  41.89 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
213 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  43.24 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  40.54 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  40 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  44.93 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  46.15 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  40.54 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  41.27 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  40.79 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  43.24 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  38.27 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  43.94 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  42.19 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  36.11 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>