188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3521 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  90.48 
 
 		 84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  89.29 
 
 		 84 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  89.29 
 
 		 84 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  89.29 
 
 		 84 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  89.29 
 
 		 84 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  84.52 
 
 		 84 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  83.13 
 
 		 84 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  97.22 
 
 		 84 aa  147  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  74.7 
 
 		 83 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  76.19 
 
 		 84 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  71.95 
 
 		 83 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  83.78 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  83.33 
 
 		 83 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  79.73 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  78.38 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  71.08 
 
 		 82 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  69.88 
 
 		 83 aa  130  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  73.42 
 
 		 82 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  70.59 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  66.27 
 
 		 82 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  72.22 
 
 		 84 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  77.61 
 
 		 83 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  74.63 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  68.06 
 
 		 82 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  74.63 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  73.13 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  74.63 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  74.63 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  74.63 
 
 		 82 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  73.13 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  73.13 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  71.64 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  64.56 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  73.13 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  60.76 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  60.76 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  69.7 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  70.15 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  46.75 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  57.58 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  50.75 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  49.32 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  50.79 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  44.59 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  45.83 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  45.21 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  49.32 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  42.35 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  47.44 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  45.07 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  47.44 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  47.44 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  47.44 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  48.75 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  51.39 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  45.83 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  43.06 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  46.91 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  43.66 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  45.31 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  42.35 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  45.83 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5190  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188253  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  45.83 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  45.95 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  48.75 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  46.25 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  50.79 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0634  transcription factor WhiB  48.61 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  40.96 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  43.48 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  42.19 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  46.97 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>