193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0266 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  100 
 
 
93 aa  193  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  54.32 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  50.62 
 
 
89 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  55.56 
 
 
83 aa  86.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  51.39 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  48.15 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  48.78 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  48.68 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  50 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  47.56 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  49.41 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  48.68 
 
 
84 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  48.15 
 
 
82 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  46.34 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  46.34 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  46.34 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  49.3 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  49.35 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  49.3 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  45.83 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  44.74 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  46.48 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  50.7 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  45.83 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  46.48 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  47.14 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  43.66 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  48.48 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  45.45 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  48.48 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  38.75 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  41.25 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  44.78 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  44.78 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08790  transcription factor WhiB  44.78 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0687599  normal  0.0632527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  43.28 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  42.47 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  46.97 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  42.31 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5190  transcription factor WhiB  42.47 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188253  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  43.94 
 
 
82 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  36.9 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  40.96 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  41.33 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  41.56 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  41.56 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  41.56 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  42.65 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  39.73 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  38.67 
 
 
97 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  37.66 
 
 
95 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  37.35 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  35.44 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  40 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  41.1 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  39.77 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  41.1 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  44.12 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  40.26 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  41.67 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  38.67 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  37.66 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  45.59 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  39.74 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  47.06 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  39.74 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  39.74 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  45.59 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  45.59 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  37.33 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  40.28 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  43.28 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  42.25 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  39.74 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  44.12 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  42.65 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  40.26 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  38.67 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1721  transcription factor WhiB  37.93 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  40.74 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1506  transcription factor WhiB  38.46 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  37.66 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  36.11 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  38.03 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  39.51 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  34.29 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  37.68 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  41.33 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  38.57 
 
 
210 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  39.51 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  34.72 
 
 
102 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  41.03 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  37.84 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>