135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0566 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  51.39 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  57.41 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  44.58 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  50.77 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  49.23 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3459  transcription factor WhiB  47.22 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  45.59 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  42.68 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  45.57 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  40.91 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  40.91 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  48.44 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  47.89 
 
 		 155 aa  67  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  47.54 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  47.54 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  47.54 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  50 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  51.85 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  50 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  51.85 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  51.85 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  50 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  51.85 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  50 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  44.29 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  51.85 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  50 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  48.15 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  50 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  33.65 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  47.17 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  40 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  32.98 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  41.94 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  41.38 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  41.51 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  36.36 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  42.37 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  40.62 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  33.85 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  40.74 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  36.51 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  37.14 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  40.74 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  36.51 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  40 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  45.83 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7485  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  34.92 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  41.94 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  38.46 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  40.32 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  34.92 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  41.94 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  34.21 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  41.94 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  43.14 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  35.59 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  39.68 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  40.32 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  35.21 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  32.05 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  31.88 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  40.32 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  35.94 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  35.94 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0387  hypothetical protein  36.54 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  34.38 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>