136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1517 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  100 
 
 		 107 aa  220  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  54 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  57.33 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  59.21 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  62.16 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  65 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  68.33 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  62.5 
 
 		 83 aa  93.2  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  70 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  56.18 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  59.72 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  60 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  68.33 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  56.72 
 
 		 87 aa  85.9  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  53.33 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  53.73 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  60 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  54.1 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  60.32 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  40.24 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  37.68 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  39.39 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  36.23 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  40.98 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  40.32 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  39.68 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 155 aa  48.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  34.67 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  32.81 
 
 		 121 aa  48.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  32.81 
 
 		 121 aa  48.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  38.67 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  37.66 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  37.33 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  40.82 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  40.82 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  39.39 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  44 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  35 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  45.1 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  42.31 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  34.38 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  39.62 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  39.62 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>