138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  100 
 
 		 130 aa  260  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  53.17 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  68 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  58.67 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  67.14 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  65.71 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  73.33 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  73.33 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  73.33 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  71.67 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  68.33 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  65 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  62.16 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  65 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  71.67 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  52.22 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  55.56 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  56 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  50.65 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  65 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  61.19 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  66.22 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  66.67 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  55.41 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  52.81 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  66.67 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  58.82 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  51.35 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  49.21 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  44 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  41.03 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  39.34 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  43.04 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  51.02 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  51.02 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  51.02 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  51.02 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  36.59 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  51.02 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  36.63 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  51.02 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  35.92 
 
 		 133 aa  47.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  45.9 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  36.96 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  51.02 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  36.26 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  41.43 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  41.82 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2326  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  36.9 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  36.9 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  36.9 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  36.9 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  32.5 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  36.05 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  43.64 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  42.42 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  32 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  47.37 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  30.77 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  30.77 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 177 aa  43.5  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  36.76 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  34.67 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  37.5 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  35.48 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  46.43 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  30.99 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  35.94 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  44.68 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  36.25 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 118 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 108 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  32.43 
 
 		 90 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>