165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0936 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  100 
 
 		 109 aa  213  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  80.26 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  59.26 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  63.89 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  59.72 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  56.58 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  50 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  65.62 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  45.65 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  62.5 
 
 		 93 aa  86.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  54.17 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  54.17 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  48.28 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  54.55 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  54.17 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  54.41 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  46.99 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  53.33 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  56.67 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  59.02 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  47.89 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  49.21 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  53.33 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  41.98 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  35.37 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  40.79 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  51.85 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  45 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  42.47 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  39.73 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  42.86 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  39.19 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  42.86 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  35 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  35.71 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  31.33 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  41.27 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  29.21 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  29.21 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  37.68 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  36.92 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  39.47 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  40.98 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  42.47 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  49.15 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  50 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  36.76 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  50 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>