165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  72.46 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  48.33 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  52.43 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  54 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  55.26 
 
 		 97 aa  94.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  47.27 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  54.67 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  65.57 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  54.67 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  62.12 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  56.92 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  62.12 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  58.33 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  57.38 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  57.38 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  56.67 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  57.38 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  55 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  55.74 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  39.74 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  38.36 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  47.27 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  47.06 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  34.88 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  41.07 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  32 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  30.12 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  30.49 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14620  Transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  40.74 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  34.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  31.51 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  30.77 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  34.15 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  30.77 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  44.44 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  34.15 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2828  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.506614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  29.17 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1165  WhiB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.797116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2608  transcription factor WhiB  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  31.25 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>