158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0929 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  66.22 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  55.56 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  60 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  62.5 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  61.43 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  61.43 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  50.51 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  54.02 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  62.86 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  60.87 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  61.11 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  76.67 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  57.33 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  54.79 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  52 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  57.58 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  61.84 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  53.33 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  57.38 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  53.33 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  50.6 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  57.14 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  47.54 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  53.23 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  51.61 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  35.06 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  29.33 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  29.33 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  36.07 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  38.16 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  47.06 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  46.43 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  32.53 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  37.66 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  36 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1165  WhiB family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.797116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  34.38 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  36.51 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  65.52 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  65.52 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  35.62 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  36.71 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  37.14 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  34.83 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  50 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  34.52 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  32.89 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  38.78 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  36.51 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  60 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  35.62 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  48.89 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 108 aa  43.5  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>