166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4278 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  100 
 
 		 118 aa  239  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  90.68 
 
 		 118 aa  193  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  70.33 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  75.31 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  68.24 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  74.44 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  70.37 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  77.65 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  73.33 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  77.65 
 
 		 102 aa  116  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  75.29 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  64.71 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  65.59 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  74.42 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  60.92 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  60.92 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  60.92 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  66.23 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  59.77 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  59.77 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  49.17 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  67.82 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  54.44 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  62.64 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  69.14 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  66.25 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  67.9 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3098  transcription factor WhiB  58.7 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.918982  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0605  transcription factor WhiB  59.52 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  48.68 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  39.53 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  44.59 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  41.46 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  49.32 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  44.29 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  47.95 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  46.58 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  40.23 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  44.78 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  46.75 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  38.82 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  43.94 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  44.93 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  39.74 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  38.3 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  38.3 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  38.3 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  43.28 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  47.95 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  47.95 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  47.95 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  47.95 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  46.58 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  47.95 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  46.58 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  46.58 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  42.47 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  42.42 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  36.59 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  44.29 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  44.29 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  37.35 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  46.97 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  38.24 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  39.19 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  33.71 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  35.37 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  36.78 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  41.43 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0556  WhiB family cell cycle control transcriptional regulator  43.94 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  32.97 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  34.07 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  42.31 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  34.25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  37.93 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  34.94 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>