167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3098 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3098  transcription factor WhiB  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.918982  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  65.79 
 
 		 103 aa  106  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  63.22 
 
 		 97 aa  106  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  62.34 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  62.03 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  64.94 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  63.64 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  59.04 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  59.04 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  59.04 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  61.33 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  61.33 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  56.96 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  58.67 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  64.04 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  70.89 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  54.21 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  66.27 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  68.83 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  64.2 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  68.83 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  68.42 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  61.11 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  58.7 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  68.29 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  57.32 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  72.46 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0605  transcription factor WhiB  53.68 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  60.76 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  46.15 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  47.37 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  44.87 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  45.07 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  48.53 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  44.59 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  47.06 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  46.48 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  46.38 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  65.22 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  42.86 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  61.22 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  60.47 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  47.3 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  46.25 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  45 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  45.76 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  51.02 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  50.79 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  48.44 
 
 		 83 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  52.54 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  41.54 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  61.36 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  58.14 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  45.76 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  50.85 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  45.76 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  46.88 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  60 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  60 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  38.24 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  43.66 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  48.84 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  44.62 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  60 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  45.45 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  44.07 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  54.17 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  56.1 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  51.06 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  53.49 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  38.16 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  40.85 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  56.82 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  42.37 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  43.08 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>