142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0605 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0605  transcription factor WhiB  100 
 
 		 120 aa  237  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  54.26 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  56.63 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  58.44 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  56.41 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13712  transcriptional regulatory protein whib-like whiB4  48.35 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0618249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  55.84 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  50 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  50 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  50 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  52.56 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  53.75 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1366  transcription factor WhiB  53.75 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3098  transcription factor WhiB  53.12 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.918982  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  60.71 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  59.52 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  51.49 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  61.63 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  61.63 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  64.94 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  63.64 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  63.64 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  65.22 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  55.29 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  41.98 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  62.34 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  63.64 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  53.66 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  45 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  42.5 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  40.26 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  44.16 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  41.03 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  41.03 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  41.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  38.46 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  42.67 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  51.67 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  37.97 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  43.37 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  39.73 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  38.67 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  40.98 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  38.71 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  36.51 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  48.84 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  39.68 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  50.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  38.24 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  45.21 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  39.71 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  37.97 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  45.21 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  38.96 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  36.51 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  37.68 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  40 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  32.47 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  42.47 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  39.51 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0685  transcription factor WhiB  32.5 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363073  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  43.84 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  55.81 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  55.81 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  36.67 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  42.47 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0239  transcription factor WhiB  48.28 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  59.46 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  38.33 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6000  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  36.67 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  48.84 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  34.25 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  42.47 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0901  transcription factor WhiB  39.02 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  37.31 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  35.14 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  51.28 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28690  Transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  40 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>