106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4384 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  100 
 
 		 135 aa  276  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  66.22 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  61.04 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  70.49 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  54.62 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  58.33 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  69.23 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  71.67 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  50 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  60.56 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  52.75 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  62.9 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  65 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  61.29 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  67.74 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  48.72 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  55 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  47.19 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  57.38 
 
 		 97 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  59.02 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  53.85 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  50 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  53.33 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  57.38 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  56.67 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  53.75 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  52.46 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  48.39 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  56 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  36 
 
 		 106 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  40 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  43.75 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  36.49 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  46 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  27.45 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  27.45 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  46 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  48 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  46 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  46 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  34.25 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  41.82 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  36.51 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  46 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  46 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  46.15 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  39.62 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  46 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  37.84 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  36.84 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  40.35 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  29.41 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1165  WhiB family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.797116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  35.53 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  35.38 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0833  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  43.1 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  36.84 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  37.1 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  44.07 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  43.86 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  31.51 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  42 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  38.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  36.67 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  44 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3938  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.593836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  42 
 
 		 118 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  38.18 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  42 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  27.47 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  30.85 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1482  transcription factor WhiB  37.5 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.514846  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  30.14 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  34.69 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0495  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4824  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4910  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695176  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5211  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  40.68 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  36.73 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  36 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  34.69 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>