119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2963 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  100 
 
 
87 aa  173  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  79.31 
 
 
89 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  66.67 
 
 
92 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  63.51 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  63.24 
 
 
113 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  68.18 
 
 
83 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  59.46 
 
 
92 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  64.29 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  67.19 
 
 
93 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  68.25 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  58.67 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  63.16 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  52.78 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  68.85 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  68.85 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  68.85 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  62.65 
 
 
107 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  66.67 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  68.33 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  61.67 
 
 
99 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  69.74 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  64.56 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  62.71 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  62.3 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  60.66 
 
 
135 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  67.11 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  65.57 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  57.38 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  65 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  53.42 
 
 
97 aa  80.1  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  61.67 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  53.03 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  40.68 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  46.97 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  37.5 
 
 
210 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  53.06 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  39.39 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  36.11 
 
 
213 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  32.26 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  32.26 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  40.62 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  40 
 
 
181 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  38.89 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  37.74 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  38.89 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  42 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  45.45 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  36.11 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  40 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  40 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  32.26 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  40 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  44.44 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  38.71 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  40 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  47.73 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  46.67 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  48.89 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  48.98 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  36.36 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  38 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  40 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  37.5 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  46.94 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  40 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  36.21 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  38.89 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  65.52 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  65.52 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  44.68 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  40 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  38 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  38 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  38 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  44.68 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  40 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  40 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  46.94 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  46.94 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  46.94 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  38 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  47.17 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  36.99 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  46.94 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3098  transcription factor WhiB  46.81 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.918982  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  46.94 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  36.67 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  39.66 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  32.86 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  46.94 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  43.86 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  60 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  38.1 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  36 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  33.82 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  38 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  45.65 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  36 
 
 
176 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  40.28 
 
 
160 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>