90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1181 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  49.19 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  56 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  49.09 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  57.33 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  59.62 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  56 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  51.95 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  71.05 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  66.22 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  65 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  55 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  69.74 
 
 		 87 aa  84.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  66.23 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  47.25 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  53.33 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  60 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  60 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  60 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  63.33 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  56.67 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  56.45 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  56.67 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  61.67 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  50 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  41.82 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13450  transcriptional regulatory protein whib-like whiB3  35.71 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000048092  hitchhiker  0.00462059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  40.38 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  39.29 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  31.25 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  31.25 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  38.1 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3694  transcription factor WhiB  43.64 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  40.35 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  39.29 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  40 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  38.78 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  39.44 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  51.61 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  38.78 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  40 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1009  transcription factor WhiB  39.29 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  36 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  33.85 
 
 		 108 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 85 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1165  WhiB family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.797116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  52.94 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  52.94 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  29.47 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  35.29 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  40.74 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  32.35 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  40.82 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  39.29 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1830  hypothetical protein  36.21 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0114549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  38.78 
 
 		 85 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  38.18 
 
 		 90 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  42.59 
 
 		 90 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>