27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1830 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  306  9e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0114549  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0387  hypothetical protein  31.94 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  56.1 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  44.64 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  42.11 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3478  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  48.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  45.65 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 103 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  63.33 
 
 		 104 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 97 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 103 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  46.51 
 
 		 103 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  63.33 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  46.51 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  43.9 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  39.62 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  48.78 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  48.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  50 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  35.9 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  54.29 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  54.29 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  36.21 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  45 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  60 
 
 		 104 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>