24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2729 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2729  transcription factor WhiB  100 
 
 		 106 aa  215  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000363198  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2525  transcription factor WhiB  82.42 
 
 		 106 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000638956  hitchhiker  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  34.57 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  31.65 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  36.36 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  38.18 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  37.68 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  31.34 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  35 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  35.71 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  31.67 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  34.55 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  33.82 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  38.6 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  31.25 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  32.73 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  32.73 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  32.73 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  30.77 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  32.14 
 
 		 96 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>